发布时间 : 星期五 文章chemsketch 教程更新完毕开始阅读9c899dd176eeaeaad1f33073
ACD/ChemSketch
Version 10.0 for Microsoft Windows
中文使用指南
化学结构式和图形图像的绘制
高级化学发展有限公司（ACD）
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目 录 目 录 .................................................................................................................................................................... 3 1.
ACD/CHEMSKETCH基础 ........................................................................................................................ 7 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 2.
目标： .................................................................................................................................................... 7 启动ACD/CHEMSKETCH ....................................................................................................................... 7 设定可兼容的文件类型 ........................................................................................................................ 7
1.3.1
改变可兼容的文件类型 ................................................................................................................ 8 改变默认路径 ........................................................................................................................................ 8 安装附件 ................................................................................................................................................ 8 退出CHEMSKETCH ................................................................................................................................ 9
绘制简单结构 .............................................................................................................................................. 10 2.1 2.2
目标 ...................................................................................................................................................... 10 画原子、化学键和标签 ...................................................................................................................... 10
使用常用画图工具 ...................................................................................................................... 10
2.2.2 双键和三键................................................................................................................................... 11 2.2.3 个别原子的删除 ........................................................................................................................... 11 2.2.4 撤销命令....................................................................................................................................... 11 2.2.5 聚合物 .......................................................................................................................................... 11 2.2.6 非原子 ......................................................................................................................................... 12 2.2.7 改变原子...................................................................................................................................... 12 2.2.8 使用连续画图工具 ...................................................................................................................... 13 2.2.9 使用鼠标拖拽绘图 ...................................................................................................................... 14 2.2.10 优化结构...................................................................................................................................... 14 2.2.11 编辑原子标签 .............................................................................................................................. 14 2.2.12 使用画链工具 .............................................................................................................................. 15 2.3 清除屏幕 .............................................................................................................................................. 16 2.4 使用ACD/字典 ................................................................................................................................... 16 2.5 翻转结构 .............................................................................................................................................. 17 2.6 输出 ...................................................................................................................................................... 19 2.6.1 保存ChemSketch(.sk2)文件 ........................................................................................................ 19 2.6.2 保存结构为 MDL Molfile 格式 ................................................................................................. 19 2.6.3 打印 ............................................................................................................................................. 20 2.6.4 在文件中插入结构式 .................................................................................................................. 20
3.
绘制更复杂结构 .......................................................................................................................................... 21 3.1 3.2 3.3 3.4 3.5 3.6
目标 ...................................................................................................................................................... 21 使用基团表 .......................................................................................................................................... 21 使用环节构 .......................................................................................................................................... 22 删除原子和基团 .................................................................................................................................. 23
2.2.1
3.4.1
同时删除多个原子 ...................................................................................................................... 24
替换原子 .............................................................................................................................................. 24 设置双键和三键 .................................................................................................................................. 25
3
3.7 3.8 3.9 3.10 3.11 3.12 3.13 4.
标定电荷和定义阳离子与阴离子 ...................................................................................................... 25 标记键 .................................................................................................................................................. 27
3.8.1
原子团标记键 .............................................................................................................................. 28 使用立体键 .......................................................................................................................................... 29 绘制配位键 ...................................................................................................................................... 30 离域电荷及曲线 .............................................................................................................................. 33 更多键类型 ...................................................................................................................................... 34 改变原子属性 .................................................................................................................................. 37
超级结构、简化线性分子式和化学反应式 .............................................................................................. 39 4.1 4.2
目标 ...................................................................................................................................................... 39 2D－优化 ............................................................................................................................................. 39
创建环烷烃结构 .......................................................................................................................... 39 4.2.2 画环形的缩氨酸 .......................................................................................................................... 40 4.3 简化线性分子式(SMILES NOTATIONS) .............................................................................................. 41 4.3.1 创建简化线性分子式 .................................................................................................................. 42 4.3.2 从简化线性分子式创建结构式 .................................................................................................. 42 4.4 IUPAC国际化学标识分子式 ............................................................................................................. 43 4.4.1 生成国际化工标识分子式 .......................................................................................................... 43 4.4.2 从国际化学标识分子式生成结构 .............................................................................................. 44 4.5 3D－优化 ............................................................................................................................................. 45 4.5.1 创建双[2，2，2]环己烷结构 ..................................................................................................... 45 4.5.2 创建三蝶烯结构 .......................................................................................................................... 46 4.5.3 创建立方烷结构 .......................................................................................................................... 47 4.5.4 创建C20球碳分子 ....................................................................................................................... 49 4.6 绘制、标记和映射化学反应 .............................................................................................................. 50 4.6.1 绘制化学反应 .............................................................................................................................. 50 4.6.2 标记化学反应 .............................................................................................................................. 52 4.6.3 映射化学反应 .............................................................................................................................. 52 4.6.4 计算化学反应数据——仅限商业版！ ....................................................................................... 54
5.
高级绘制：模型 .......................................................................................................................................... 56 5.1 5.2 5.3
目标 ...................................................................................................................................................... 56 概述 ...................................................................................................................................................... 56 原子团表 .............................................................................................................................................. 56
4.2.1
创建荧光胺结构 .......................................................................................................................... 56 5.4 快速模型工具 ...................................................................................................................................... 58 5.4.1 创建环状体聚物结构 .................................................................................................................. 58 5.5 模型窗口 .............................................................................................................................................. 59 5.5.1 创建DNA分子片断 .................................................................................................................... 59 5.5.1.1 绘制去氧核糖-5-磷酸盐链的图象 ......................................................................................................... 60 5.5.1.2 添加碱基 ................................................................................................................................................. 61
5.6 5.7
绘制复杂的生物化学结构 .................................................................................................................. 61 5.6.1
5.3.1
创建β-麦芽糖酶结构 ................................................................................................................ 61 定义用户模型 ...................................................................................................................................... 63
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