3 蛋白质化学 生物化学习题汇编 sqh 联系客服

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33、假设某蛋白质含有10个羧基,平均pK为3.5;2个咪唑基,平均pK为6.0;14个NH3+,平均pK为10.0。从 pH 1 开始用Na0H 滴定,试问达到等电点时应有多少个H+ 被滴定掉?画出蛋白质的滴定曲线,并标明等电点的位置。[1]

34、图3-4是由末端没有封闭的一条多肽链组成的蛋白质滴定曲线。(1)列出该蛋白质中所有可能的滴定基团和相应的 pKa 值。(2)估计该蛋白质分子中每一种可滴定的基团有多少?(假设每分子蛋白质中有36个可滴定的基团,而所有的半胱氨酸残基均包含在二硫键中)。(3)

1

33、(1)因为该蛋白质分子含有10个羧基,2个咪唑基,14个 -NH3,共有26个(10+2+14)解离的质子。

+

蛋白质的pI是指蛋白质分子所带净电荷为零时溶液的 pH 值。当该蛋白质分子中10个羧基的 H+,2个咪唑基的 H+ 和 4个 -NH3+ 的 H+ 被滴定掉,即有16个质子被滴定掉时蛋白质分子的净电荷为零(见图3-9),这时就到达了该蛋白质的pI。

(2)为了画出蛋白质的滴定曲线,可粗略地计算一下不同pH值时每分子蛋白质解离的质子数,列于表3-3

表3-3 不同 pH 时,每分子蛋白质解离的质子数 pH值 解离的H+数 1 0 3.5 6 11 10 19 12 5 26 以pH值作横坐标,每分子蛋白质解离的H+数作纵坐标,作

该蛋白质的滴定曲线(图3-10),从滴定曲线上可看到,当16个质子被滴定掉时溶液的pH值约为9.5,这就是该蛋白质的pI。

估计这个蛋白质的相对分子质量,并简述理由。 1

[1]

34、(1)有八种可滴定的基团,列于表3-4

表3-4 蛋白质可滴定基团的pKa值

滴定基团 C端α-羧基 γ-和β-羧基 咪唑基 N端的α-氨基

大约的pKa值

3 4~5 6~7 8

滴定基团 β-巯基 酚羟基 ε-氨基 胍基

大约的pKa值

8 9~10 10~11 12~13

(2)该蛋白质分子中,有一个C端的α-羧基和一个N端的α-氨基。侧链的羧基在低于pH=pKa的情况下,也就是说大约低于 pH 5.5 时可能被滴定。

从图3-4可知,在 pH 2 到 pH 5.5 之间共有11个可滴定的基团,扣除C端的一个α-羧基,那么共有10

个侧链羧基。

扣除N端的α-氨基,所以有4个咪唑基。

在 pH 5.5 到 pH 8.5 范围内,可滴定的应该是咪唑基和N端的α-氨基,在该范围内滴定了5个基团(16-11),假如在pH值低于10时,所有酚羟基均能滴定的话,那末分子中共有6个酚羟基(22-16)。这样余下的14个可解离的质子一定来自ε-氨基和胍基。虽然在pH 12左右,滴定曲线比较陡峭,不能很清楚地把两者区别开来。因为大部分ε-氨基在pH值低于12时应该被滴定,而胍基要高于12才被滴定。所以很自然地可以猜出14个可滴定的质子中8个来自ε-氨基,6个来自胍基,图3-4中所示的是牛胰核糖核酸酶的滴定曲线。表3-5列出这蛋由质真实的可滴定基团的数目。

表3-5 核糖核酸酶中可滴定的基团 滴定基团 C端α-羧基 γ-和β-羧基

存在数目

1 10

滴定基团 酚羟基 ε-氨基

存在数目

6 10

35、有A、B、C三种不同蛋白质,在 pH 7进行电泳,结果如图3-5所示。

若在 pH 7 用中性盐沉淀这三种蛋白质,哪种蛋白质首先沉淀?哪种次之?哪种最后? [1] 36、一些异常血红蛋白(HbD、HbJ、HbN、HbC)和正常血红蛋白(HBA)仅仅是一个氨基酸的

差异。

将上述四种异常血红蛋白与正常血红蛋白在 pH 8.6条件下进行电泳,电泳迁移率如下:

问:a带、b带、c带和d带分别代表哪种异常血红蛋白?[2]

咪唑基 N端的α-氨基

4 1

胍基

4

(3)6种氨基酸共出现34次,则每种氨基酸出现的平均频率为34/6,假设这种频率是有代表性的,那末在这蛋白质中氨基酸的数目可用下式来估计:

34/6×20=113

氨基酸的平均相对分子质量为120,所以该蛋白质的相对分子质量为

113×120=13600

幸运的是这个数值与真实的牛胰核糖核酸酶的相对分子质量很接近(Mr=13700)。然而,一般来说,可滴定氨基酸的平均频率是没有代表性的,所以用这种方法来计算相对分子质量通常是不正确的。

1

35、从电泳结果可知 pH 7 时蛋白质C带的电荷最多,蛋白质B其次,蛋白质A最少。pH 7 用中性盐沉淀时,电荷带得最少的首先沉淀,所以蛋白质A首先沉淀,其次是蛋白质B,最后是蛋白质C。 36、(1)HbD是由一个碱性氨基酸(Lys)取代了中性氨基酸。在 pH 8.6 时,Lys的ε-氨基呈 -NH3+ 状态,所以 HbD 比 HbA 带更多的正电荷,向阴极移动。

2

(2)HbJ是由一个酸性氨基酸(Asp)取代了中性氨基酸。在pH 8.6时,Asp的β-羧基呈 -COO- 状态,所以HbJ 比 HbA 带更多的负电荷,向阳极移动。

(3)HbN是由一个酸性氨基酸(Glu)取代了碱性氨基酸(Lys)。在pH 8.6时,Glu的γ-羧基呈 -COO- 状态,所以HbN比HbJ带更多的负电荷,向阳极移动。

若将HbN和HbJ比较,因为HbN是由一个酸性氨基酸取代了碱性氨基酸,而HbJ是一个酸性氨基酸取代了中性氨基酸。所以HbN比HbJ带更多的负电荷,HbN向阳极移动的速度比HbJ快.

(4)HbC是一个碱性氨基酸(Lys)代替了酸性氨基酸(Glu)。在pH 8.6时,Lys的ε-氨基呈 -NH3+ 状态,所以HbC与HbD带更多的正电荷,向阴极移动。

若将HbC与HbD比较,HbC是一个碱性氨基酸取代了酸性氨基酸,而HbD是一个碱性氨基酸取代了中性氨基酸,所以HbC比HbD带更多的正电荷,HbC向阴极移动的速度比HbD快。 综上所述可知:a带代表HbC,b带代表HbD,c带代表HbJ,d带代表HbN。

37、正常人血红蛋白(HbA)的β-链经胰蛋白酶水解可得一肽段为:

Val-His-Leu-Thr-Pro-Glu-Glu-Lys

镰刀状贫血病血红蛋白(HbS)的β-链经胰蛋白酶水解可得一肽段为:

Val-His-Leu-Thr-Pro-Val-Glu-Lys

试讨论:

(1)在 pH 5.0 和 8.0 时,这两个八肽的电泳行为。

(2)若正常的八肽被一个六肽取代,N端的5个氨基酸不变,在 pH 8.0 时,此六肽在电场中不移动,问C端是什么氨基酸才会有这种电泳行为。

各解离基团的pK值如下:末端-NH3+ 7.0,末端-COOH 3.4,咪唑基 6.0,γ-COOH 4.0,ε-NH3+ 10.8。[1]

38、在体外,用下列方法处理,对血红蛋白与氧的亲和力有什么影响? (1) pH 值从7.0增加到7.4

(2)CO2分压从 1000 Pa 增加到 4000Pa (3)O2分压从 6000Pa 下降到 2000Pa

(4)2,3-二磷酸甘油酸的浓度从8×10-4 mol/L 下降到 2×10-4 mol/L (5)α2β2解聚成单个亚基[2]

39、在下面指出的 pH 值,下述蛋白质在电场中将向哪个方向移动?即向阳极(A)、阴极(C)或不动(O)。(1)卵清蛋白,在 pH 5.0;(2)β-乳球蛋白,在 pH 5.0和 7.0; (3)胰凝乳蛋白酶原,

1

37、(1) pH5.0时

HbA:+Val-His+-Leu-Thr-Pro-Glu--Glu--Lys± 净电荷为零,在电场中不移动。

HbS: +Val-His+-Leu-Thr-Pro-Val-Glu--Lys± 净电荷为+1,在电场中向阴极移动。 pH 8.0 时

HbA:Val-His-Leu-Thr-Pro-Glu--Glu--Lys± 净电荷为-2,向阳极移动。

HbS:Val-His-Leu-Thr-Pro-Val-Glu-Lys± 净电荷为-1,向阳极移动。 pH 8.0时

HbA的八肽向阳极移动的速度比HbS的八肽快。 (2)pH 8.0 时

六肽中N端5个氨基酸的带电情况如下: Val-His-Leu-Thr-Pro-(即N端5个氨基酸不带电荷)

根据题意六肽在电场中不移动,即净电荷要为零。只有当C端是Lys或Arg时,才有这种电泳行为。

2

38、(1)pH值增加,Hb与氧的亲和力增加。

(2)CO2分压增加,Hb与氧的亲和力下降。 (3)O2分压下降,Hb与氧的亲和力下降。 (4)2,3-DPG浓度下降,Hb与氧的亲和力增加。 (5)α2β2解聚成单个亚基,Hb与氧的亲和力增加。