发布时间 : 星期三 文章酵母双杂交操作步骤(中文翻译)更新完毕开始阅读626922743868011ca300a6c30c2259010202f3ce
(酵母菌储存在-70℃中,引物和质粒DNA储存在-20℃中) 概念:
1. 次序转化:指的是先将一种质粒转化进酵母中(常是DNA-BD/bait plasmid),在选择培养基中选择出阳性克隆,之后再将另外一个质粒(AD fusion library)转化进去。优点:就是比共转化使用更少的质粒DNA,也就是节约质粒DNA。
2. 共同转化:将两种质粒一起转化进酵母中。优点:比次序转化更容易操作。 pGBKT7----的选择物是:kanamycin(卡那霉素)? pGADT7----的选择物是:ampicillin (氨苄西林) ?
各种SD培养基:
1) SD/-ade(腺嘌呤)/-leu(亮氨酸)/-trp(色氨酸)/-his (组氨酸)(1000 ml) (?
“四缺”)
酵母氮源(YNB):6.7g ;
-ade/-leu/-trp/-his DO supplement 0.60g (购买来就配好的) ; 葡萄糖 20g (即2%)
2) SD/-leu/-trp/-his (1000 ml)
酵母氮源(YNB):6.7g ;
-leu/-trp/-his DO supplement 0.62g ; (购买来就配好的) 葡萄糖 20g. (即2%)
3) SD/-leu/-trp (1000 ml) (?“二缺”)
酵母氮源(YNB):6.7g ;
-ade/-leu/-trp/-his DO supplement 0.64g (购买来就配好的); 葡萄糖 20g (即2%)
4) SD/-leu (1000 ml)
酵母氮源(YNB):6.7g ;
-leu DO supplement 0.69g ; (购买来就配好的) 葡萄糖 20g (即2%)
5) SD/-trp (1000 ml)
酵母氮源(YNB):6.7g ;
-ade/-leu/-trp/-his DO supplement 0.74g ; (购买来就配好的) 葡萄糖 20g (即2%)
注意:YNB有两种,一种含有硫酸胺,另外一种不含硫酸胺。我们这用的是含硫酸铵的。(买来就加进去了的)。如果不含硫酸铵,那么要在终浓度0.17%的YNB中再加入0.5%的硫酸铵,即最终在1000 ml溶液中加入总量为6.7g的YNB与硫酸铵。
实际配制的方法是:
1. 配制40%的葡萄糖贮存液(贮存在4℃),过滤除菌,待高压灭菌的溶液温度降至55℃
以下时,再将50ml葡萄糖贮存液加入。(过滤即可使用) 2. 酵母氮源6.7g,加DO supplement 在920ml水中溶解,调PH至5.8(大约加10M NaOH
200ul即可),之后补水至950 ml。
3. 高压完后待温度降至55℃以下,加入50 ml40%葡萄糖。
YPD培养基(1000 ml)
20 g/L 蛋白胨 10 g/L 酵母提取物
20 g/L 琼脂(只有制作平板才用) 20 g/L 葡萄糖 (即2%)
1x YPDA培养基(1000 ml)
20 g/L 蛋白胨 10 g/L 酵母提取物
0.03 g/L 腺嘌呤 (即终浓度为0.003%)腺嘌呤可以耐受高温 20 g/L 葡萄糖 (即2%)
实际配制的方法是:
1. 配制40%的葡萄糖贮存液(贮存在4℃),过滤除菌,待高压灭菌的溶液温度降至55℃
以下时,再将50ml葡萄糖贮存液加入。(李博士经验这一步不高压,过滤即可使用) 2. 配制0.2%的腺嘌呤溶液,过滤除菌,待高压灭菌的溶液温度降至55℃以下时,再将15ml
腺嘌呤溶液加入。(或将腺嘌呤直接加进去,为了方便我将直接加进去一起高压) 3. (蛋白胨 20g ;酵母提取物10g ;水大约925ml)混合后,调至PH至6.5,加水至935ml,
121℃高压15min。 注意:
? 高压的温度和时间不能太长与太高,121℃高压15min即可。 ? 可以在YPDA中加入20 g/L的琼脂,以配成平板。 ? 需要加kanamycin时,kan终浓度是10–15 mg/L。(kanamycin可以20℃贮存一个月,
加入到平板中去可以4℃贮存一个月。)
PEG/LiAc溶液(即配即用)
用下列贮存液来配制
50% PEG 3350:用灭菌水配,如需要可以加热至50℃以助溶。 10X TE buffer:用灭菌水配,如需要可以加热至50℃以助溶。 10X LiAc:用灭菌水配,如需要可以加热至50℃以助溶。 最后配成PEG/LiAc溶液是:(以10ml为例)
终浓度 为配制10mlPEG/LiAc需要加入的物质 PEG 4000 40% 8 ml of 50% PEG TE buffer 1X 1 ml of 10X TE LiAc 1X 1 ml of 10X LiAc
无菌1x TE/LiAc溶液(用10x已灭菌的贮存液稀释)
10x TE buffer : 0.1 M Tris-HCl, 10 mM EDTA, pH 7.5(高压) 10x LiAc : 1 M 用稀醋酸调节PH至7.5 高压
For β-galactosidase 滤膜实验 Z buffer溶液:
Na2HPO4? 7H2O 16.1 g/L (如换Na2HPO4? 14H2O 则 20.739 g/L) NaH2PO4? H2O 5.50 g/L (如换NaH2PO4? 2H2O 则 6. 21g/L) KCl 0.75 g/L MgSO4 ? 7H2O 0.246 g/L
最后调PH至7.0,高压,室温下可以贮存1年
X-gal 溶液:
X-GAL溶解于DMF(二甲基甲酰胺)中至浓度为20 mg/ml.,–20°C避光保存
Z buffer/X-gal 溶液:
100 ml Z buffer
0.27 ml β-mercaptoethanol (β-巯基乙醇) 1.67 ml X-gal 贮存液
ONPG 溶液:(即配即用)
ONPG溶于Z buffer中,终浓度4 mg/ml,调PH至7.0. 注意:
1. ONPG需要1~2h才能溶解 2. 每次用之前新鲜制备。
带有β-巯基乙醇的Z buffer
将0.27 mlβ-巯基乙醇加入100 ml Z buffer中即可
为了转化成功的小提示:
1.用一个1~3周龄(直径2~3mm)的菌落去接种液体培养基。如果菌落直径<2mm,就用多几个菌落去接种。(也要大力涡旋使细胞团分散开来。) 2.如果过夜或者3hr之后的培养基明显成块,那么在使用之前一定要充分涡旋使培养基。 3.当通过离心收集细胞的时候,使用一个离心管即可,可以更好、更充分地收集细胞。 4.为了提高转化效率,要在1小时内准备酵母感受态细胞。如果有必要,可以在11步之后在室温条件下储存酵母感受态细胞几个小时,而活性却只有一点降低。
5.当进行通同转化的时候,诱饵(BD)质粒的量必须过度,而AD质粒的量要不足。
一般BD是AD的两倍。(李博士:此要求一般是针对文库筛选而言)
6.为了使菌落更好地生长,在涂布转化复合物到琼脂平板上时要直到所有液体被吸收。可以选择直径5mm的无菌玻璃珠(每一个100mm的平板用5-7个玻璃珠,直径150mm的平板用7-9个玻璃珠)去促进转化复合物的扩散,摇动的时候shake the plate back and forth—not round and round. (科内似并无此操作,而仅仅以玻棒涂布耳)
一. 复苏酵母:将酵母细胞接种到YPD固体培养基中培养,培养1-3周。(接种的时
候采取四区分区画线法)
二. 酵母感受态细胞置备和转化步骤:
1.取直径2~3mm的克隆接种到1ml的YPD或SD培养基中。 2.剧烈振荡或涡旋5min,使所有团块分散开来。
3.转移酵母液到50 mlYPD(?固体——也有液态的,未加入琼脂粉耳)或者SD培养基中。 4.置于30℃摇床中,以250 rpm的转速震荡培养基16~18h,直到OD600>1.5
5.转移部分过夜培养物(30ml)到300mlYPD培养基(?固体)中,使最终OD600 在0.2~0.3之间。
6.30℃摇床以230 rpm的转速震荡培养基3~4h直至OD为 0.4~0.6. (If the OD600 is < 0.4, something is wrong with the culture) 7.转移酵母液至50ml离心管中,1000g室温(20~21°C)离心5min 8.弃去上清,加入25~50ml无菌水或无菌的1x TE重悬酵母。 9.在1000g室温(20~21°C)条件下离心5min 10.轻轻倒出(弃去)上清
11.将细胞重悬于1.5ml新鲜准备的,无菌的1xTE/1xLiAc(在实验开始之前置备)
(至此酵母感受态细胞制备完毕)
12. 向无菌的1.5ml微量离心管中加入质粒DNA各0.1ug和0.1mg鲱鱼精载体DNA,之后轻轻混匀。
13.再向每管中加入0.1 ml 酵母感受态细胞,并且震荡混匀。 14.向每一管加入600 ul无菌PEG/LiAc溶液,高速振荡混匀。 15.30℃摇床以200 rpm的转速振荡培养30 min
16.向每一管加入70 ul DMSO 轻轻颠倒混匀,不要震荡。 17.42℃水浴热激15 min
18.取出后在冰上冷却1-2 min
19.1000 rpm室温离心5 min,弃去上清。 20.用0.5 ml 无菌的1×TE重悬酵母。
21.取合适体积的菌液(一般是100 ul)涂在选择性的SD培养基的平板上,在30℃培养箱中培养2-4天。(将克隆分成三份涂与不同平板上,1/3涂在SD/–His/–Leu/–Trp,1/3涂在SD/–Ade/–His/–Leu/–Trp,最后1/3涂在SD/–Leu/–Trp上。) (科内仅涂布二缺与四缺板) (在21步之后涂一个二缺板和一个四缺板)因为在二缺板中AH109能生长,说明BD和AD已经转进去了。如果在四缺板中能生长,说明诱饵和文库肯定有作用,接着做一个α- gal实验。如果是将质粒转到Y187中的话,21步之后涂一个二缺板就行了。如果酵母能生长