发布时间 : 星期日 文章细菌的分类与命名-微生物命名规则更新完毕开始阅读45f0951bcc22bcd126ff0cab
目前较稳定的基因型细菌分类法有如下几种。 （一）DNA G+C mol/%测定
DNA分子两条链上4种碱基的总分子量为100，测定其中G+G或A+T摩尔百分比，能反映出细菌间DNA分子同源程度，习惯上以G+C作为细菌分类标记。不同菌属间的G+Cmol%范围很大，在25%~75%之间，但同一种细菌G+Cmol%相当稳定，不受菌龄、培养条件和其他外界因素影响，亲缘关系越近的细菌，它们G+C mol/%越相近。目前测定的技术多用加热变性法。加热变性的DNA由于双链DNA分开，使A 260紫外吸收度增加。紫外吸收度的增加与解链程度成正比。用Tm表示DNA分子中50%解链时的温度，Tm随G+Cmol%的含量线性增加。在通常条件下，G+Cmol%为40的DNA其Tm约为87℃，每增加1%G+Cmol含量，Tm约增加0.4℃，因而通过Tm可测出G+Cmol%含量。 （二）核酸同源值测定
同一种细菌的G+Cmol%固然应该相同，但G+Cmol%相同的却并不一定是同一细菌。因为G+Cmol%不能反映其碱基的序列。精确的办法是利用DNA分子杂交技术测定DNA分子的相似度。其基本步骤均是先提取菌株的DNA，加热变性解链，然后将两种变性的DNA（其中一种为标记DNA或rRNA）混合液在一定的温度下保温复性，重新得到杂交的双螺旋DNA分子，鉴定其双螺旋结合率。结合率的大小反映了DNA碱基序列的相似程度和菌种之间的亲缘关系的亲疏。DNA/DNA杂交时，同一菌的结合率为100%，80%~90%的同源为同一种内、同一亚种的细菌，60%~70%的同源性为同一种内不同亚种的细菌，20%~60%则认为是同一属中的不同菌种。 （三）核蛋白体RNA碱基序列测定
细菌核蛋白体RNA序列比较保守，其变化十分缓慢。分离提取细菌16SrRNA，用T1核酸酶消化，分析寡核苷酸的碱基序列可测出rRNA的相关性。绘制各类群关系和树状谱，从而确定种系的发生关系。另一种研究核蛋白体RNA碱基序列的方法是rRNA-DNA杂交，其基本原理和DNA-DNA杂交方法相同，只是最后的结果表示方法不同，常用于两个有差距的微生物间测定，例如用rRNA-DNA杂交将假单胞菌属至少可分成5群rRNA同源群。
细菌分类系统
国际上普遍采用伯杰（Bergey）分类系统，自1923年《伯杰鉴定细菌学手册》（Bergey’s mannual of determinative bacteriology）第一版问世以来，每隔四五年修订一次，至1974年已出版至第八版。1984年将其易版为《伯杰系统细菌学手册》（Bergey’s manual of systemic bacteriology），共分4卷。在此新版中，对细菌的高级分类作了重新安排，以细菌细胞壁的结构特点，将原核生物界分为4个菌门：薄壁菌门（Gracilicutes）、厚壁菌门（Firmicutes）、软壁菌门（Tenericutes）和疵壁菌门（Mendosicutes）。伯杰系统细菌学手册第1卷（1984年）登载医学、工业和普通微生物中重要革兰阴性细菌；第2卷（1986年）为放线菌外的革兰阳性菌，第3卷为古细菌、蓝藻菌和其他革兰阴性菌；第4卷为放线菌。 1994年出版《伯杰鉴定细菌学手册》第9版，该版摘录《伯杰系统细菌学手册》第1卷~4卷所有菌属的表型描述，把所有细菌根据类型排列成1~35群，除群11蓝藻菌保留“目”分类单位，其余细菌不设目，除了群5保留肠杆菌科、弧菌科和巴斯德菌科科名和群11蓝藻菌科外，其他均无科名，但以细菌表型为基础的
4个主要类型和《伯杰系统细菌学手册》提出的4个菌门正好相对应。 临床上也有采用CDC系统分类，该系统由美国疾病控制和预防中心（center for disease control and prevention，CDC）使用核酸杂交和核酸序列分析结果编排，如肠杆菌科的CDC分类法。